rt-pcr的导出数据的tm值是啥意思

2021-01-10 20:49:22 字数 1581 阅读 1067

1楼:容易特意

引物tm是设值和合成引物时的tm值, 也就是理论值。

而pcr产物tm值是在实际操作中摸索出来的温度值 引物tm值与pcr产物tm值这两个不同的引物当然退火温度也不相同,一般在设计引物的时候,程序就会显示出tm值是多少.在做pcr的时候,将退火温度设定

荧光定量pcrtm值代表啥意思

2楼:满意请采纳哟

tm值和溶解曲线是为了检测pcr反应特异性的,

主峰前的一个小峰可能是非特异性扩增,

也可能是引物二聚体,可以降低引物浓度试试

rt-pcr的引物如何设计?

3楼:匿名用户

引物可以通过一些软件设计,比如primer 5 ,但是还需要注意一些细节问题。

比如1.引物最好在模板cdna的保守区内设计。 dna序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的。

在ncbi上搜索不同物种的同一基因,通过序列分析软件(比如dnaman)比对(alignment),各基因相同的序列就是该基因的保守区。

2.引物长度一般在15~30碱基之间。 引物长度(primer length)常用的是18-27 bp,但不应大于38,因为过长会导致其延伸温度大于74℃,不适于taq dna 聚合酶进行反应。

3.引物gc含量在40%~60%之间,tm值最好接近72℃。 gc含量(***position)过高或过低都不利于引发反应。

上下游引物的gc含量不能相差太大。另外,上下游引物的tm值(melting temperature)是寡核苷酸的解链温度,即在一定盐浓度条件下,50%寡核苷酸双链解链的温度。有效启动温度,一般高于tm值5~10℃。

若按公式tm= 4(g+c)+2(a+t)估计引物的tm值,则有效引物的tm为55~80℃,其tm值最好接近72℃以使复性条件最佳。

4楼:匿名用户

先找出你要扩增的“保守序列”的所有碱基,到专门的设计软件上搜索最佳引物序列。

软件和软件的使用在丁香园上均可找到。

http://****dxy.**/bbs不过一开始最好有设计过的人在身边指点,不然会有很多问题

5楼:匿名用户

http://****bbioo.***/bio101/2007/20171.htm

上面有很清楚

的设计方法。

6楼:许无忧

建议你去借分子克隆实验指南来看看,或者采用引物设计软件,比如primer premier 5,把序列输入就可以得到不同打分的引物对

7楼:归跃卜叶丰

microrna的茎环引物可以自己设计。据说有公司也可以帮忙合成,不过还是自己设计好了发过去比较省钱吧。内参一般是u6,因为它长度和microrna一样比较短。

我做的反转录内参是跟microrna分开管子转的real-time

quantification

ofmicrornas

bystem–loop

rt–pcr

这篇文献上有比较容易看懂的茎环引物的图。也可以看看几篇相关的中文文献都有。

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