实时荧光定量pcr中什么可以不需要延伸阶段

2021-01-10 20:49:21 字数 4066 阅读 2457

1楼:匿名用户

1.sybrgreenⅰ法:

在pcr反应体系中,加入过量sybr荧光染料,sybr荧光染料特异性地掺入dna双链后,发射荧光信号,而不掺入链中的sybr染料分子不会发射任何荧光信号,从而保证荧光信号的增加与pcr产物的增加完全同步。

sybr定量pcr扩增荧光曲线图

pcr产物熔解曲线图(单一峰图表明pcr扩增产物的单一性)2.taqman探针法:

探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;pcr扩增时,taq酶的5’-3’外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条dna链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与pcr产物的形成完全同步。

实时荧光定量pcr内参是什么东西

2楼:禾鸟

1、实时荧光定量pcr内参:

在不同的pcr反应管中已定量的内参和引物,内参用基因工程方法合成。上游引物用荧光标记,下游引物不标记。在模板扩增的同时,内参也被扩增。

在pcr产物中,由于内参与靶模板的长度不同,二者的扩增产物可用电泳或高效液相分离开来,分别测定其荧光强度,以内参为对照定量待检测模板。

2、选择:内参一般是固定的,可以用实验室之前就有的。或者用基因工程方法合成。上游引物用荧光标记,下游引物不标记。

扩展资料

(1)内参在传统定量中的作用:

由于传统定量方法都是终点检测,即pcr到达平台期后进行检测,而pcr经过对数期扩增到达平台期时,检测重现性极差。同一个模板在96孔pcr仪上做96次重复实验,所得结果有很大差异,因此无法直接从终点产物量推算出起始模板量。

加入内参后,可部分消除终产物定量所造成的不准确性。但即使如此,传统的定量方法也都只能算作半定量、粗略定量的方法。

(2)内参对定量pcr的影响:

若在待测样品中加入已知起始拷贝数的内标,则pcr反应变为双重pcr,双重pcr反应中存在两种模板之间的干扰和竞争,尤其当两种模板的起始拷贝数相差比较大时,这种竞争会表现得更为显著。

但由于待测样品的起始拷贝数是未知的,所以无法加入合适数量的已知模板作为内参。也正是这个原因,传统定量方法虽然加入内参,但仍然只是一种半定量的方法。

3楼:小笑聊情感

实时荧光定量pcr内参是一种在dna扩增反应中,以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(pcr)循环后产物总量的方法。通过内参或者外参法对待测样品中的特定dna序列进行定量分析的方法。

4楼:匿名用户

内参就是一个表达量在各个组基本保持不变的基因,又叫看家基因,比如常用的gapdh, actin。或者18s rrna也可以。

如果内参表达量一致,说明你pcr的上样量一致,样本的质量也一致。如果出入很大,说明你的样本的浓度或者是质量有问题。测到的目的基因的表达量就不可靠了

5楼:匿名用户

管家基因,具体可以咨询公司,也可以自己看文献,常用的有gapdh,beta-actin和18srna,根据不同的**选用不同的管家基因,比如gapdh就被人诟病做癌细胞基因时超不准。。。

6楼:xueling黄

如果对内参要求很高的话,可以筛选合适内参,有免费的软件,比如genorm,normfinder等

实时荧光定量pcr的结果该怎样分析?

7楼:群英斗将

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;

2、一般都是相对量,则用delta delta ct方法来计算;

3、引物或探针降解:可通过page电泳检测其完整性;

4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;

5、看ct值是分析荧光定量pcr最直观的一个数据,ct值一般在35左右就失去参考价值了,平时我们实验室用biodai-pcr荧光定量法测得的扩增曲线的起跳值基本在30左右。

扩展资料:

pvr的循环参数:

1、预变性;

模板dna完全变性与pcr酶的完全激活对pcr能否成功至关重要,加热时间参考试剂说明书。

2、变性步骤;

循环中一般95℃,30秒足以使各种靶dna序列完全变性,可能的情况下可缩短该步骤时间。变性时间过长损害酶活性,过短靶序列变性不彻底,易造成扩增失败。

3、引物退火;

退火温度需要从多方面去决定,一般根据引物的tm值为参考,根据扩增的长度适当下调作为退火温度。然后在此次实验基础上做出预估。退火温度对pcr的特异性有较大影响。

4、引物延伸;

引物延伸一般在72℃进行(taq酶最适温度)。但在扩增长度较短且退火温度较高时,本步骤可省略延伸时间随扩增片段长短而定,一般推荐在1000bp以上,含pfu及其衍生物的衍生设定为1min/kbp。

5、循环数;

大多数pcr含25-35循环,过多易产生非特异扩增。

6、最后延伸;

在最后一个循环后,反应在72℃维持10-30分钟.使引物延伸完全,并使单链产物退火成双链。

8楼:南京金益柏生物科技****

用2-△△ ct法算的话,应如何算? 假设检测a基因,ct分别为(这里记住ct越大,表明相对含量越低) 普通组/test1:28 实验组1/test2:

29 实验组2/test3:30 这时候要设对照了,假设test1为对照组(普通组),当然是以普通组为对照 那么,相对含量为。

9楼:匿名用户

看ct值、起始拷贝数、标准偏差等

如果是sybr做的话,再看下溶解曲线

实时荧光定量pcr与普通pcr的区别是什么?结果有何异同?能说明的问题是什么?

10楼:么破1自我

二者结果相同。都能说明生物体外的特殊dna复制的整个过程的扩增效率和溶解温度情况。

区别:1、二者系统组成不同

荧光定量pcr仪比普通的pcr仪多了荧光信号采集系统和计算机分析处理系统。

2、二者原理不同

荧光定量pcr实时监测与dna结合的荧光染料激发的荧光,普通ocr通过检测插入dna中核算染料的量来测定pcr最终产物量。

3、二者反应要求不同

荧光定量pcr对扩增片段有较高的要求,一般为100-300bp,普通pcr可以扩增长点的片段。

4、二者应用不同

荧光定量pcr主要是用来定量分析和确定基因转录水平的,普通的pcr仪是做定性分析和扩增基因片段,定量pcr仪可以做普通pcr仪的工作,反之不行。

5、二者测量成本不同

定量pcr仪**较为昂贵,普通的基因扩增仪(pcr仪)只能够定性地分析是否存在目标片段。但是**要低很多,而且运行成本也要低很多。

实时荧光定量pcr技术有效地解决了传统定量只能终点检测的局限,实现了每一轮循环均检测一次荧光信号的强度,并记录在电脑软件之中,通过对每个样品ct值的计算,根据标准曲线获得定量结果。

11楼:匿名用户

原理不同:荧光定量pcr实时监

测与dna结合的荧光染料激发的荧光;普通pcr通过检测插入dna中核算染料的量来测定pcr最终产物量,一般是紫外光。

反应要求:荧光定量对扩增片段有较高的要求,一般为100-300bp;普通定量可以扩增长点的片段。如果不需要检测产物分子量大小,荧光定量可以不进行电泳就对产物进行定量分析,普通pcr必须电泳。

结果:荧光定量可以实现精确定量,普通pcr则不行。荧光定量体现可以看到整个扩增过程,可以看到扩增效率,溶解温度,直接得到的标准曲线等,这些是普通pcr无法实现的。

如果还不清楚建议去丁香园等**逛逛,希望可以帮到你

12楼:匿名用户

所谓实时荧光定量pcr技术,是指在pcr反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个pcr进程,最后通过标准曲线对未知模板进行“定量分析”的方法。

记住,实时荧光定量是定量分析

13楼:匿名用户

荧光pcr是为了测量mrna表达量的 普通pcr是为了扩增目的片段的

14楼:匿名用户

荧光定量是定量的,普通pcr是定性的,结果一个是说明含有多少,另一个说明有还是没有,前者更精确一点

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