1楼:砂粒
rna测序
bai深度,当reads(50bp,single end )数目du从2.5m增加zhi到10m时,roc曲线质量增加的dao很明显,reads数目从10m增加到30m时,roc没有显著的提高回。答当reads的数目从2.
5m增加到10m时,发现差异基因的能力( 类似于敏感度 )和数目都有显著的提高,而reads的数目大于10m时,就显得疲软了。
logfc( fold change 取对数)的变异系数( cv ),这个变异系数越小,说明fold change的值在不同重复间的重复性更好,结果更优。同样看到reads数目从2.5m增加到10m时候,变异系数减小的明显,而reads数目大于10m后,曲线的趋势趋于平缓。
为什么高通量测序dna是深度,rna测序是多少m
2楼:倚云昭阳揽雁声
由于rna表达的时空和时间的特异性,所以不同时刻或者是同一时刻不同组织内rna表达的数目有着较大的差别,所以我们在说rna的测序数据量时就不能够用测序深度来表示。一般在说rna测序时会说我们测了多少的cluster, 就是打断后的rna分子。比如说某一个rna样本测序用了30m(30million)的cluster,采用双端测序技术,就是每个cluster从两端都测一次,每次测150bp,所以就会得到30m*2=60m的reads数,然后reads数乘以每条read的长度就是我们最后的测序数据量(碱基数),即为60m*150=9g的碱基数。
3楼:
基因组测序的测序深度一般是10x。
测序深度是指测序得到的总碱基数与待测基因组大小的比值。假设一个基因大小为2m,测序深度为10x,那么获得的总数据量为20m。
基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,**罹患多种疾病的可能性,个体的行为特征及行为合理,如癌症或白血病,运动天赋,酒量等。
为什么二代测序又叫深度测序
4楼:士诚小人也
在二代测序中,为了有效覆盖全基因组,获得的数据量一般是被测基因组的几十倍,然后再拼接。
也就是说,理论上,每个位点都要被覆盖几十次甚至上百次,这个次数就叫测序深度
所以,二代测序也成为深度测序
高通量基因组测序中,什么是测序深度和覆盖度
5楼:匿名用户
可以简单理解为深度是一条链上一个碱基检测到的次数,
覆盖度是你检测到的这个样本的总碱基数的百分比
rna测序与整个基因组测序相比有什么优势
6楼:加菲熊猫
朋友你好!
虽然rna种类多样,但我们拿来测序的一般是信使rna即mrna。众所周知mrna是核内基因表达时通过转录修饰后的产物,其直接通过招募核糖体结合trna进行翻译表达。因此相比于dna,mrna上既没有复杂庞大的非表达dna部分(这类dna元件不会转录出mrna),也不含内含子等表达基因的冗余部分,可以说mrna是最接近所表达的蛋白产物的模板了。
因此rna测序直观,简洁,高效的反映了某一时刻生物体蛋白质的表达水平,具有简洁性和时效性。
希望帮到你,欢迎追问~
7楼:手机用户
网页链接
rna-seq助力遗传疾病诊断
8楼:菅勃纪曼安
rna测序也就是所谓的rna-seq,通常指的是转录组测序,只测细胞中的转录本。只有基因组中被转录出来的那部分能测到。通常用于寻找差异表达基因以及发现新基因。
而基因组测序是整个基因组都测,不管转录不转录,通常用于基因组组装,重测序进行基因分型等。
这是根本不同的两个东西,一个是测转录组,一个是测基因组,它们的不同就是转录组和基因组的不同。至于优势,根据自己的目的来判断吧。
欢迎追问。
rna测序与整个基因组测序相比有什么优势?
9楼:匿名用户
rna测序也就是所谓的rna-seq,通常指的是转录组测序,只测细胞中的转录本。只有基因组中被转录出来的那部分能测到。通常用于寻找差异表达基因以及发现新基因。
而基因组测序是整个基因组都测,不管转录不转录,通常用于基因组组装,重测序进行基因分型等。
这是根本不同的两个东西,一个是测转录组,一个是测基因组,它们的不同就是转录组和基因组的不同。至于优势,根据自己的目的来判断吧。
欢迎追问。
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