1楼：year淡然做自己
不同的测序原理不一样，分别概述如下：第一代测序，1.1 sanger 测序 采用的是直接测序法；1.
2 连锁分析 采用的是间接测序法。新一代测序 (ngs)主 要 包 括 全 基 因 组 重 测 序 (whole-genomesequencing，wgs)、全外显子组测序
(whole-exomesequencing，wes) 和目标区域测序 (targeted
regionssequencing，trs)，它们同属于新一代测序技术：1 目标区域测序 目前常用的是基因芯片技术；2 全外显子组测序 (wes) 外显子组是单个个体的基因组 dna 上所有蛋白质编码序列的总合，基因测序结果与ncbi的snp数据库、千人基因组数据库等国际权威数据库比对，最终确定是否为突变基因。
基因组测序的原理与方法及关进设备？
2楼：杨风游
全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。1986年， renato dulbecco是最早提出人类基因组定序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列，对於癌症的研究将会很有帮助。
美国能源部（doe）与美国国家卫生研究院（nih），分别在1986年与1987年加入人类基因组计划。除了美国之外，日本在1981年就已经开始研究相关问题，但是并没有美国那样积极。到了1988年，詹姆士·华生（dna双螺旋结构发现者之一）成为nih的基因组部门主管。
1990年开始国际合作。1996年，多个国家召开百慕达会议，以2005年完成定序为目标，分配了各国负责的工作，并且宣布研究结果将会及时公布，并完全免费。
1998年，克莱格·凡特的塞雷拉基因组公司成立，而且宣布将在2001年完成定序工作。随后国际团队也将完成工作的期限提前。2000年6月26日，塞雷拉公司的代表凡特，以及国际合作团队的代表弗朗西斯·柯林斯（francis collins），在美国**柯林顿的陪同下发表演说，宣布人类基因组的概要已经完成。
2001年2月，国际团队与塞雷拉公司，分别将研究成果发表於《自然》与《科学》两份期刊。在基因组计划的研究过程中，塞雷拉基因组使用的是霰弹枪定序法（shotgun sequencing），这种方法较为迅速 ，但是仍需以传统定序来分析细节。全基因组测序技术主要包括第二代测序技术（ngs）和第三代测序技术。
第二代测序技术已经能够快速、低成本的进行全基因组测序，其设备**商主要是solexa （现被illumina公司合并），454（罗氏公司）和solid（ab公司）。第三代测序技术于2011年4月正式推广，其单分子实时（**rt）测序技术完全不同与第二代测序，它的序列读长高达3000 bp（pacific biosciences 公司研发）。
简化基因组测序和基因组测序的区别
3楼：匿名用户
一、16s测序原理16srdna基因存在于所有细菌的基因组中，具有高度保守性。然而该基因序列还包括9个高变区（v1-v9），通过特异性引物对某一段高变区（如v3区）或某几段高变区（如v3-v4区）进行扩增测序，然后与数据库比对，可特异性识别细菌种类。
二、宏基因组测序原理将基因组dna随机打断成若干条500bp的小片段（类似于拼图中的单个形状不一的模块），然后连接接头（双端120bp），在片段两端加通用引物进行pcr扩增测序。将reads进行组装拼接（类似于将众多模块拼成一副完整**），得到基因序列，众多基因构成完整的基因集。同时将获得的reads片段或组装好的基因序列与ncbi数据库进行比对，得到物种注释结果。
对于16s测序而言，任何一个高变区或几个高变区，尽管变异性再高，对于某些物种来说，这些高变区也可能十分相近，而能够区分它们的特异性序列片段有可能不在我们的扩增区域内。换言之，非全长的可变区序列覆盖范围不够导致无法鉴定到种。宏基因组在建库之前会先将基因组dna随机打断成若干小片段，而这些小片段中总有一些能够包含区分2个物种的基因差异序列。
由于测序深度足够深，相当于覆盖了整个基因组的信息，因此在与ncbi数据库比对时，就能够注释到相应的种水平的物种。
细菌全基因组测序请问现在全基因组测序完成后会的到
4楼：悠悠我心
目前已完成全基因组测序的物种主要可以分类三大类，模式物种、农作物和经济作物、有药用价值的物种。在模式物种这块，众所周知的，拟南芥、果蝇、斑马鱼、小鼠、大鼠等等；而农作物和经济作物大概有以下：水稻、玉米、大豆、甘蓝、白菜、高粱、黄瓜、西瓜、马铃薯、番茄、拟南芥、杨树、麻风树、苹果、桃、葡萄、花生；在药用这块，目前主要有一些真菌类，例如灵芝、茯苓等，以及一些药用植物，例如丹参、长春花等。
已经做完细菌的全基因组测序，怎么能够找到我要的某个基因的代谢路径呢？ 50
5楼：匿名用户
代谢通路是kegg数据库里的pathway数据库。可以通过全基因组**了编码基因后，进行pathway数据库注释，从注释结果的功能信息中通过关键字查找。一般都能找到。
如果找不到，有可能是关键字不对或者基因组中没有这样的代谢通路功能基因。
一般现在的科技服务公司如果做了kegg pathway数据库注释的话，都会做代谢通路图的注释，可以从结果文件中的代谢通路图查找，找到想要的代谢通路图后，再分析哪些基因在基因组上存在。
dna测序的原理?基因组测序的原理？
6楼：匿名用户
我认为有的。
dna序列测定分手工测序和自动测序，手工测序包括sanger双脱氧链终止法和maxam-gilbert化学降解法。自动化测序实际上已成为当今dna序列分析的主流。自动化测序是在sanger法基础上发展而来的。
dna测序的原理，要答 maxam-gilbert化学降解法、sanger双脱氧链终止法和现在发展起来的焦磷酸化测序的原理。
如果说现在最常用的测序原理，应答自动化测序：采用毛细管电泳技术取代传统的聚丙烯酰胺平板电泳，应用该公司专利的四色荧光染料标记的ddntp(标记终止物法)，因此通过单引物pcr测序反应，生成的pcr产物则是相差1个碱基的3'末端为4种不同荧光染料的单链dna混合物，使得四种荧光染料的测序pcr产物可在一根毛细管内电泳，从而避免了泳道间迁移率差异的影响，大大提高了测序的精确度。由于分子大小不同，在毛细管电泳中的迁移率也不同，当其通过毛细管读数窗口段时，激光检测器窗口中的ccd(charge-coupled device)摄影机检测器就可对荧光分子逐个进行检测，激发的荧光经光栅分光，以区分代表不同碱基信息的不同颜色的荧光，并在ccd摄影机上同步成像，分析软件可自动将不同荧光转变为dna序列，从而达到dna测序的目的。
http://****biobars.**/article/view.asp?id=309
基因组测序的原理：则涉及到样品的制备、大规模的测序，以及序列分析等
参见http://****majorbio.***/teq/454-gs_flx.shtml
高通量基因组测序中，什么是测序深度和覆盖
7楼：匿名用户
简洁版：
深度即：测序得到的总碱基数/基因组碱基数 。也可以理解为将基因组测了几遍。
测序深度能减少假阳性和测序错误率。 覆盖度原来是指基因/转录组上测序测到的部分占整个组的比例，但是现在很多人把coverage也直接当depth用了。
详细版： depth嘛，就是被测基因组上单个碱基被测序的平均次数，比如某样本的测序深度为30x，那么就是说该样本的基因组上每一个单碱基平均被测序（或者说读取）了30次，注意，是平均。当然了，depth也有最大和最小值，这个都可以由信息分析得到。
coverage就好理解了，由于大片段拼接的gap、测序读长有限、重复序列等问题的存在，测序分析后组装得到的基因组序列通常无法完全覆盖所有区域，覆盖度就是最终得到的结果占整个基因组的比例。例如一个人的基因组测序，覆盖度为98.5%，那么说明该基因组还有1.
5%的区域通过我们的组装和分析无法得到。
至于什么算法之类的，太深了，应该不用了解吧~~偶也写不出来。。。:p
当然，转录组也同上，
8楼：豆颖环力学
可以简单理解为深度是一条链上一个碱基检测到的次数,
覆盖度是你检测到的这个样本的总碱基数的百分比
全基因组测序的意义是什么？
9楼：太阳_爱向日葵
全基因组测序的意义是使人类从根本上认知疾病发生的原因，做到正确的**疾病、尽早的预防疾病。
定义：全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。
发展历程：1986年， renato dulbecco是最早提出人类基因组定序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列，对於癌症的研究将会很有帮助。
美国能源部(doe)与美国国家卫生研究院(nih)，分别在1986年与1987年加入人类基因组计划。除了美国之外，日本在1981年就已经开始研究相关问题，但是并没有美国那样积极。到了1988年，詹姆士·华生(dna双螺旋结构发现者之一)成为nih的基因组部门主管。
1990年开始国际合作。1996年，多个国家召开百慕达会议，以2005年完成定序为目标，分配了各国负责的工作，并且宣布研究结果将会及时公布，并完全免费。
简介：每个人从受精卵开始就继承了父母的dna遗传信息，并且携带一生，不易改变。全基因组测序就是通过运用新一代高通量dna测序仪，进行10-20倍覆盖率的个人全基因组测序，然后与人类基因组精确图谱比较，得到完整的个人全基因组序列，破译个人全部的遗传信息的过程。
全基因组测序覆盖面广，能检测个体基因组中的全部遗传信息；准确性高，其准确率可高达99.99%。
全基因组测序揭示了人类生、老、病、死的奥秘，使人类从根本上认知疾病发生的原因，做到正确的**疾病、尽早的预防疾病。
技术：提取基因组dna，然后随机打断，电泳**所需长度的dn**段（0.2~5kb），加上接头,进行基因簇cluster制备或电子扩增e-pcr，最后利用paired-end（solexa）或者mate-pair（solid）的方法对插入片段进行测序。
然后对测得的序列组装成contig，通过paired-end的距离可进一步组装成scaffold，进而可组装成染色体等。组装效果与测序深度与覆盖度、测序质量等有关。目前常用的组装有：
soapdenovo、trimity、abyss等。