1楼:北京索莱宝科技****
不是一bai
个范畴的内容.
直接pcr测序du
法一般是指我们zhi直接采
用测序的方dao式来鉴定的方法内,与其对等的一般是容比如说是在基因型鉴定的rflp,str啊等等.
而sanger测序只是测序技术中的一种方法,于此对等的是像ngs啊,n-ngs啊等测序方法.
两者间的差异在于,前者是班级这个层面上的,而后者是班级里的一个人这个层面上的.
一代测序技术包括哪些?
2楼:匿名用户
包括sanger测序,str亲子鉴定、法医鉴定,snapshot测序技术,实时荧光定量pcr。
上个世纪末90年代,与“曼哈顿原子弹计划”和“阿波罗登月计划”具有同样划时代意义的“人类基因组计划”启动,这是人类第一次在分子水平上全面地认识自我。随着人类基因组计划的开展,人们对基因与疾病的关系认识更加深入,有机会通过对基因缺陷的检测分析来判断各种疾病发生的风险,并由此衍生出一种新的健康服务项目—基因测序。
sanger测序经过38年的发展已相当完善,成本也降低了10倍以上,现在国际上仍然是基因测序行业的金标准和主力军。sanger测序是目前所有基因测序的国际金标准,是包括荧光定量pcrtaqman探针法、普通pcr法、芯片法、二代测序法、质谱法等方法的金标准。
2010年以来,出现了很多新一代测序仪产品,新一代测序成本低、数据大、速度快,但都有待成熟,准确度不够高。
(一)、sanger测序
被检测的dna碱基顺序依次读出800bp以上,是一代所有测序和新一代所有测序的金标准。代表仪器美国abi3730xl,sanger测序一般医院很少开展,开展的都发公司做。耗时长达 13年之久的人类基因组计划也是依靠sanger测序法才得以最终完成的。
sanger 测序是针对已知致病基因的突变位点设计引物,进行pcr 扩增直接测序。单个突变点的扩增(包括该位点在内的外显子部分片段的扩增),不必将该点所在基因的全部外显子都扩增。所以单基因或部分基因控制的疾病样本检测,sanger 测序可以发挥精准和成本低的优势。
(二)、str亲子鉴定、法医鉴定
通过测定dn**段的长度和颜色,来确定遗传关系。是sanger测序技术基础上,发展起来的一个技术,所用仪器与sanger测序所用仪器一样,检测原理一样,一台设备装两套检测软件,一台仪器具有三个功能。代表仪器美国abi 3130、3130xl、3730仪器,一般司法机构和sanger测序公司拥有该仪器,医院没有。
亲子鉴定就是通过对dna遗传片段检测,判定父母与子女之间的亲缘关系。
(三)、snapshot测序技术
snapshot技术是美国应用生物公司(abi)开发,是荧光标记单碱基延伸的分型技术,也称小测序,主要针对中等通量的snp突变分型项目检测。通常用于10~30个snp突变位点分析。是sanger测序技术基础上,发展起来的一个技术,和sanger测序仪器一样,检测原理一样,一台设备装有两套检测软件,一台仪器具有三个功能。
代表仪器美国abi3130、3130xl、3730仪器,一般sanger测序公司拥该有仪器。
优势:1、分型准确,2、通量高,3、检测速度快,4、不受snp位点多态性特性限制,5、不受样本个数限制。snapshot技术是新一代测序技术(包括二代测序和芯片测序)snp突变检测的金标准,sanger测序技术又是snapshot技术突变检测的金标准。
(四)、实时荧光定量pcr
利用荧光信号积累实时监测整个pcr过程,最后通过标准曲线(或者与内参对照)对未知模板进行定量分析。代表仪器美国abi 7500荧光定量pcr仪等,一般三甲医院都有该类仪器,普及较好。使用方便维护简单。
1、突变寻找:定量pcr taqman探针杂交。2、基因定量:
相对荧光定量pcr,医学上用来检测细菌或病毒rna的表达量。荧光定量pcr是1996 年由美国abi 公司推出的一种新定量实验技术。
实时荧光定量pcr应用领域:临床疾病诊断:各型肝炎、艾滋病、禽流感、结核、性病等传染病诊断和疗效评价,地中海贫血、血友病、性别发育异常、智力低下综合症、胎儿畸形等优生优育检测,肿瘤标志物及瘤基因测序,遗传基因测序。
请问各位生物大侠,一代测序技术包括哪些呢,能详细点吗?
3楼:匿名用户
包括sanger测序,str亲子鉴定、法医鉴定,snapshot测序技术,实时荧光定量pcr。
上个世纪末90年代,与“曼哈顿原子弹计划”和“阿波罗登月计划”具有同样划时代意义的“人类基因组计划”启动,这是人类第一次在分子水平上全面地认识自我。随着人类基因组计划的开展,人们对基因与疾病的关系认识更加深入,有机会通过对基因缺陷的检测分析来判断各种疾病发生的风险,并由此衍生出一种新的健康服务项目—基因测序。
sanger测序经过38年的发展已相当完善,成本也降低了10倍以上,现在国际上仍然是基因测序行业的金标准和主力军。sanger测序是目前所有基因测序的国际金标准,是包括荧光定量pcrtaqman探针法、普通pcr法、芯片法、二代测序法、质谱法等方法的金标准。
2010年以来,出现了很多新一代测序仪产品,新一代测序成本低、数据大、速度快,但都有待成熟,准确度不够高。
(一)、sanger测序
被检测的dna碱基顺序依次读出800bp以上,是一代所有测序和新一代所有测序的金标准。代表仪器美国abi3730xl,sanger测序一般医院很少开展,开展的都发公司做。耗时长达 13年之久的人类基因组计划也是依靠sanger测序法才得以最终完成的。
sanger 测序是针对已知致病基因的突变位点设计引物,进行pcr 扩增直接测序。单个突变点的扩增(包括该位点在内的外显子部分片段的扩增),不必将该点所在基因的全部外显子都扩增。所以单基因或部分基因控制的疾病样本检测,sanger 测序可以发挥精准和成本低的优势。
(二)、str亲子鉴定、法医鉴定
通过测定dn**段的长度和颜色,来确定遗传关系。是sanger测序技术基础上,发展起来的一个技术,所用仪器与sanger测序所用仪器一样,检测原理一样,一台设备装两套检测软件,一台仪器具有三个功能。代表仪器美国abi 3130、3130xl、3730仪器,一般司法机构和sanger测序公司拥有该仪器,医院没有。
亲子鉴定就是通过对dna遗传片段检测,判定父母与子女之间的亲缘关系。
(三)、snapshot测序技术
snapshot技术是美国应用生物公司(abi)开发,是荧光标记单碱基延伸的分型技术,也称小测序,主要针对中等通量的snp突变分型项目检测。通常用于10~30个snp突变位点分析。是sanger测序技术基础上,发展起来的一个技术,和sanger测序仪器一样,检测原理一样,一台设备装有两套检测软件,一台仪器具有三个功能。
代表仪器美国abi3130、3130xl、3730仪器,一般sanger测序公司拥该有仪器。
优势:1、分型准确,2、通量高,3、检测速度快,4、不受snp位点多态性特性限制,5、不受样本个数限制。snapshot技术是新一代测序技术(包括二代测序和芯片测序)snp突变检测的金标准,sanger测序技术又是snapshot技术突变检测的金标准。
(四)、实时荧光定量pcr
利用荧光信号积累实时监测整个pcr过程,最后通过标准曲线(或者与内参对照)对未知模板进行定量分析。代表仪器美国abi 7500荧光定量pcr仪等,一般三甲医院都有该类仪器,普及较好。使用方便维护简单。
1、突变寻找:定量pcr taqman探针杂交。2、基因定量:
相对荧光定量pcr,医学上用来检测细菌或病毒rna的表达量。荧光定量pcr是1996 年由美国abi 公司推出的一种新定量实验技术。
实时荧光定量pcr应用领域:临床疾病诊断:各型肝炎、艾滋病、禽流感、结核、性病等传染病诊断和疗效评价,地中海贫血、血友病、性别发育异常、智力低下综合症、胎儿畸形等优生优育检测,肿瘤标志物及瘤基因测序,遗传基因测序。
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