1楼:匿名用户
read是读长,就是bai一个反应能du
测出的碱基数 congtig是将很多zhiread根据序列拼接在一起拼出的dao片段,理论上回同一个染色体上的read结合起来答拼出一个contig,但实际上做不到.contig中所以的碱基序列是已知的 在高通量测序前,会构建一定长度的文库(譬如8k的。
高通量测序 一条read中会有两条fastq文件吗
2楼:诹加固爬
read是读长,bai就是一个反应能du测出的碱基数zhi congtig是将很多read根据序列拼dao接在一起拼出的片内段,理论上同一个容染色体上的read结合起来拼出一个contig,但实际上做不到。contig中所以的碱基序列是已知的 在高通量测序前,会构建一定长度的文库(譬如...
高通量测序技术ngs用什么仪器
3楼:换了好几个人
“普通的基因测序”应该是指“常规dna测序”吧,是用sanger法(也就是双脱氧法)进行测序的方法,目前非常普遍的是直接用abi 3730xl 进行的自动测序,基本上可以做到600bp-800bp的读长。
高通量测序的概念其实是一个相对的概念,在2000年的时候,3700、megabace等仪器上的测序也是高通量测序,是相对手工测序或者跑平板胶来说的。
不过到2005年以后,高通量测序就改指第二代测序(next generation sequencing),454、solexa(后改为illumina)和solid等第二代测序,比3730等第一代测序的通量提高了成千上万倍,甚至上亿倍,所以称为高通量测序。
ngs的特点主要有:
1、通量高。一个run能产生500mb-600gb的数据量。
2、读长相对较短。454(约400-500bp),llumina(100-250bp),solid(75-100)。
3、单位数据的成本非常低。现在很多项目测序的费用。已经非常低。生物信息分析成本变得更为重要了。
测序为什么有两个fastq文件
4楼:匿名用户
是不是序列太长分成两部分测了?
一般会给两个文件:一个是序列文件,一个是峰**件。
5楼:子木
是双端测序吧,双端测序两个很正常
ngs测序中接头起什么作用
6楼:莫奇怪最帅
read是读长,就是一个反应能测出的碱基数 congtig是将很多read根据序列拼接在一起拼出的片段,理论上同一个染色体上的read结合起来拼出一个contig,但实际上做不到.contig中所以的碱基序列是已知的 在高通量测序前,会构建一定长度的文库(譬如8k的。
高通量测序中讲的通量和读数应该怎么理解呢?有没有人可以讲的详细些,非常感谢
7楼:量子天堂
通量是指同时可以测的dna样本数目的多少,一台第一代测序仪一次性最多只能测96个样本,而一台第二代测序仪(高通量测序仪)可以同时测数万个样本。
一个读数(read)是指测序得到的一个碱基序列。
我的理解是:读数就是一个待测样本的碱基序列,是solex测序中的一个术语,读数越多,就证明测序的通量越大。
8楼:匿名用户
roche/454 测序序列读长(reads)在 3种测序技术中最长(600~1000 bp), 但其通量最低
(0.5~1 gb/run); illumina/solexa 测序通量大, 其新机型hiseq2000产出量为600 g/run, 但读长比454测序短(通常为 100 bp); abi/solid 读长最短(50 bp), 但
其创新之处在于双碱基编码的应用, 降低了测序的错误率, 而且由于其双碱基编码和校正系统的原理与重测序相似, 所以 solid 特别适用于具有高质量参考基因组序列物种的重测序.
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