1楼:匿名用户
他们是两
抄家不同公司的测序袭平台1.原理illumina的hiseq2000和454都是通过bai
单序du列的扩增放大信号,只zhi是hiseq2000中间有桥式扩增,可dao以两头测序。测序长度来讲,hiseq2000一般为1x100和2x100的模式,而454平均500bp左右,最长700左右,测序准确度来讲hiseq的测序准确度稍高一些,454由于在测序的过程每次是加一种碱基,所有如果是单碱基重复,比如aaaa,那么区分几个a的准确性就会下降。2.
数据分析和应用方向数据分析相差不大,只是不同的软件,应用方面两者各有优势,hiseq2000数据适应性更高。454一般是宏基因组种群丰度测序上应用更好一些,不过illumina也有miseq代替。3.
通量和**hiseq2000的通量要高一些,**比454便宜很多。综合来讲454现在应用面比较窄了,所以在市场上现在也慢慢被代替掉了。现在耗材和试剂也很快就停服务了。
不过hiseq现在市场上也都2500居多了,并且现在也有新的的技术更新的3000和4000。说实话现在hiseq2000也很少了。
illumina 有哪些测序仪
2楼:
illumina的测序
仪是bai以flowcell进行测du序的,一般的一张flowcell是一zhi个daorun,像hiseq2500的话是2张flowcell,也就是
一次专运行的测序量。每张flowcell上通常都有属多个通道,每个通道可以单独测不同的样品,这样的通道就是lane。hiseq2500的一张flowcell有8条通道,也就是8个lane。
如果上机前使用cbot的话可以每条lane都跑不同的样品,互不干扰,如果直接上机进行快速模式的话就无法区分不同样本了。
illumina hiseq x ten和2000的测序数据有什么区别
3楼:健振韦天
不清楚这个易瑞什么来路,目前的基因检测主要有2类,一类是通过snp位点(基本上是以snp芯片为手段,也有针对单基因或少数几个基因位点的使用的是pcr加测序或分型的方式),还有一类是对全基因组进行测序,一般目前采用的是hiseq x-ten测序。
**上第一种如果是几百万个snp位点的一般是1000元左右,如果是单基因或少数几个基因的也就几十块钱。第二种全基因组测序的一般测序深度30x以上,90g左右数据,测序费用大概在8000左右,分析snp和indel的变异费用在1000左右。
但是,目前完全不建议做。因为snp的变异与疾病和表型的研究完全不够充分。单基因的遗传疾病根本不用测序自己就看出来了,多基因的复杂疾病基因遗传因素所占比例有限,只是一个相关概率问题,而且即便知道了也没什么手段,早点拿到的数据也是一堆atcg和snp变异和所谓风险值。
还有测序和数据分析费用在飞速下降,目前上万的全基因组测序同样的数据可能1年后只用几百块,真正有效的解读也还要等到几年后,没必要花这个冤枉钱。
但是以下人群有这个切实需要:肿瘤的突变分型(目前并没有特别靠谱的高通量测序产品,主要还是基于荧光定量pcr的检测试剂盒),新生儿的遗传病筛查(看个人接受程度)
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