1楼：匿名用户
不同点很多。最简介回答，是目的不同，侧重点也不同：
普通pcr。只考虑能不能扩增出来就行。
rtpcr。上荧光的话，对引物质量要求高，得做个hplc或者page纯化；其次对引物设计要求高，考虑得率，特异性等因素。
克隆引物。考虑加入常见酶切位点，导入何种目的载体，碱基密码子偏好性等。
2楼：涛涛涛
你做的是什么实验呢？引物设计设计范围很广
pcr,rt-pcr,实时荧光定量pcr的区别与联系
3楼：永恒的瞬间绽放
1、所说的pcr应该就是最常规的pcr，以dna为模板，通过上下游引物，实现dna的扩增。
2、rt-pcr一般情况下是指反转录pcr（reverse transcription），尽管有些资料上说实时荧光定量pcr也（realtime fluores-cence quantitative pcr）也简称rt-pcr，但是这是不对的，不推荐。
基本操作过程是将所提取的rna进行反转录，然后将所获得的cdna作为模板，设计引物进行扩增，是一种检测基因表达的常用方法。
3、实时荧光定量pcr也就是real-time pcr，其最大的作用是检测样品中的初始dna浓度。
至于三者的关系，rt-pcr和实时定量pcr应该都属于pcr，在rna实验中，这二者都会应用到。
例如你要比较2个组织中的某基因的表达差异，首先你要提取2个组织的总rna，然后通过rt-pcr检测该基因是否在2个组织中有表达，然后通过实时定量pcr测定该基因在2个组织中的表达量是否具有显著性差异。
扩展资料：
pcr原理
dna的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。双链dna在多种酶的作用下可以变性解旋成单链，在dna聚合酶的参与下，根据碱基互补配对原则复制成同样的两分子拷贝。
在实验中发现，dna在高温时也可以发生变性解链，当温度降低后又可以复性成为双链。因此，通过温度变化控制dna的变性和复性，加入设计引物，dna聚合酶、dntp就可以完成特定基因的体外复制。
但是，dna聚合酶在高温时会失活，因此，每次循环都得加入新的dna聚合酶，不仅操作烦琐，而且**昂贵，制约了pcr技术的应用和发展。
耐热dna聚合酶-taq酶的发现对于pcr的应用有里程碑的意义，该酶可以耐受90℃以上的高温而不失活，不需要每个循环加酶，使pcr技术变得非常简捷、同时也大大降低了成本，pcr技术得以大量应用，并逐步应用于临床。
pcr技术的基本原理类似于dna的天然复制过程，其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。pcr由变性-退火-延伸三个基本反应步骤构成：
①模板dna的变性：模板dna经加热至93℃左右一定时间后，使模板dna双链或经pcr扩增形成的双链dna解离，使之成为单链，以便它与引物结合，为下轮反应作准备；
②模板dna与引物的退火（复性）：模板dna经加热变性成单链后，温度降至55℃左右，引物与模板dna单链的互补序列配对结合；
③引物的延伸：dna模板-引物结合物在72℃、dna聚合酶（如taqdna聚合酶）的作用下，以dntp为反应原料，靶序列为模板，按碱基互补配对与半保留复制原理，合成一条新的与模板dna链互补的半保留复制链，重复循环变性-退火-延伸三过程就可获得更多的“半保留复制链”，
而且这种新链又可成为下次循环的模板。每完成一个循环需2～4分钟，2～3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。