1楼:匿名用户
首先bai从原理上说,illumina测序du芯片是桥式扩增,形zhi成“簇”,dao终止子法
版,双向测序;454是磁珠法扩增,权利用聚合反应副产物ppi后续反应,得到荧光;abi的solid系统同样是磁珠法扩增,但利用的是连接反应(具体方法略显复杂)。
其次从性能上说,illumina测序仪的通量极大,目前的hiseq x已经达到1.6-1.8t;454则是读长最长(这三款);abi因为其连接反应测序的特点,其精度应该是最高的。
最后扒一扒他们的短儿,illumina**昂贵,尤其后期的极高通量的测序仪不是一般实验室能承受的。同时他们的仪器或许都有人看管,指定该类仪器只能进行某种生物样本的测序,当然其实性价比依然在;454的缺点,只在这三者中比的话,就是其同聚物准确度偏低;对于solid,就是读长特别短,同时因为solid的测序原理,测序系统都相对复杂,因此solid系统不好升级,到了目前似乎已经很少听说solid系统了。
高通量测序 illumina hiseq 2000 和roche454 两种平台的区别
2楼:土豆柠檬丝
他们复是两家不同公司的测序制平台
1.原理
illumina的hiseq2000和454都是通过单序列的扩增放大信号,只是hiseq2000中间有桥式扩增,可以两头测序。测序长度来讲,hiseq2000一般为1x100和2x100的模式,而454平均500bp左右,最长700左右,测序准确度来讲hiseq的测序准确度稍高一些,454由于在测序的过程每次是加一种碱基,所有如果是单碱基重复,比如aaaa,那么区分几个a的准确性就会下降。
2.数据分析和应用方向
数据分析相差不大,只是不同的软件,应用方面两者各有优势,hiseq2000数据适应性更高。454一般是宏基因组种群丰度测序上应用更好一些,不过illumina也有miseq代替。
3.通量和**
hiseq2000的通量要高一些,**比454便宜很多。
综合来讲454现在应用面比较窄了,所以在市场上现在也慢慢被代替掉了。现在耗材和试剂也很快就停服务了。
不过hiseq现在市场上也都2500居多了,并且现在也有新的的技术更新的3000和4000。说实话现在hiseq2000也很少了。
三种高通量测序仪区别 比较?
3楼:匿名用户
这些平台中,只有ion torrent 是最新的半导体测序技术,2年来发展速度很快。因此如果要客观评价的话,需要查看更新的平台比较的文章。推荐以下两篇文章:
a tale of three next generation sequencing platform: ***parison of ion torrent, pacific bioscience and illuminar miseq sequencers
***parsion of next-generation sequencing systems
另外有消息说,pgm的读长已经达到400bp了,因此在通量上也应该会有相应的增加。
这是一个高通量测序的战国时代。谁能笑到最后,大家拭目以待!
4楼:匿名用户
看一下这篇文章,这里面有着三种平台的比较:
performance ***parison of benchtophigh-throughput sequencing platforms
里面有通量、准确性、数据量、读长等的比较。
第二代基因测序技术的流程分别是什么,四种,roche 454测序技术,illumina solexa测序技术,abi solid测序
5楼:匿名用户
454测序:dna文库制备→empcr→上机测序
solexa测序:文库制备→cluster扩增→边合成边测序
solid测序:样品制备→emulsion pcr和底物准备→测序反应→图像收集→数据分析
6楼:美美
这一句两句能说清楚吗,逗人玩呢吧
什么是普通的基因测序,它和高通量测序有什么区别吗
7楼:邂逅
“普通的基因测序”应该
是指“常规dna测序”吧,是用sanger法(也就是双脱氧法)进行测序的方法,目前非常普遍的是直接用abi 3730xl 进行的自动测序,基本上可以做到600bp-800bp的读长。
高通量测序的概念其实是一个相对的概念,在2000年的时候,3700、megabace等仪器上的测序也是高通量测序,是相对手工测序或者跑平板胶来说的。
不过到2005年以后,高通量测序就改指第二代测序(next generation sequencing),454、solexa(后改为illumina)和solid等第二代测序,比3730等第一代测序的通量提高了成千上万倍,甚至上亿倍,所以称为高通量测序。
ngs的特点主要有:
1、通量高。一个run能产生500mb-600gb的数据量。
2、读长相对较短。454(约400-500bp),llumina(100-250bp),solid(75-100)。
3、单位数据的成本非常低。现在很多项目测序的费用。已经非常低。生物信息分析成本变得更为重要了。
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