1楼:匿名用户
不同的生物,甚至同种生物不同的蛋白质编码基因,对简并密码子使用频率并不相同,具有一定的偏爱性,其决定因素是:生物基因组中的碱基含量 在富含at的生物(如单链dna噬菌体fx174)基因组中,密码子第三位上的u和a出现的频率较高;而在gc 丰富的生物(如链霉菌)基因组中,第三位上含有g或c的简并密码子占90%以上的绝对优势。已知dnag和rpod(编码rna聚合酶亚基)及rpsu(30s核糖体上的s21б蛋白)属于大肠杆菌基因组上的同一个操纵子,而这3个基因产物在数量上却大不相同,每个细胞内仅有dnag产物50拷贝,而rpod为2800拷贝,rpsu则高达40 000拷贝之多。
研究dnag序列发现其中含有不少稀有密码子,也就是说这些密码子在其他基因中利用频率很低,而在dnag中却很高。许多调控蛋白如laci、arac、trpr等在细胞内含量也很低,编码这些蛋白的基因中密码子的使用频率和dnag相似,而明显不同于非调节蛋白。高频率使用这些密码子的基因翻译过程极容易受阻,影响了蛋白质合成的总量。
细胞内对应于稀有密码子的trna较少,高频率使用这些密码子的基因翻译过程容易受阻,影响了蛋白质合成的总量。
密码子偏好性分析 说明什么问题
2楼:匿名用户
核基因密码子使用偏好性分析
赤芝(ganoderma lucidum)是一种具有悠久药用历史的药用真菌,其主要活性成分灵芝三萜具有重要的药用价值,为了实现灵芝三萜的体外高效异源合成,就要首先了解赤芝的密码子使用特性,从而有针对性的提高关键酶基因在原核、真核表达系统中的表达量.通过密码子使用偏好分析,我们发现赤芝基因组总gc含量为59.5%,密码子第三位碱基gc 含量为70.
6%,说明赤芝中偏好以gc 结尾的密码子,以转录组数据为基础的分析结果一致,表示在没有基因组数据的情况下,转录组分析密码子偏好性可行.通过计算,我们得到了赤芝中的22 个最优密码子,与大肠杆菌、酿酒酵母的密码子使用特性相比,大肠杆菌稀有密码子在赤芝基因中出现的频次较低,然后酿酒酵母稀有密码子在赤芝基因中出现的频次较高,显示其对外源赤芝基因的表达会产生一定的影响.
3楼:cofe_飞
每一个物种都有其密码子使用的偏好性,在这个物种使用频率高的密码子在另一个物种里不一定高,如果两个密码子使用频率差很大,那么当这个外源基因插入到另一个物种中进行表达时(当然还要构建载体什么的,不赘述),蛋白的表达量就很低。在进行蛋白表达时,一定要考虑宿主菌的密码子偏好性,然后根据密码子的偏好性进行密码子的优化。
如何在ncbi中查基因密码子偏好性
4楼:匿名用户
ncbi没有这样的数据,你可以在codonusagedatabase查到相关物种的密码子偏好信息。
codonusagedatabase数据库用以计算密码子偏好的序列数据都是来自ncbi,也是学术界和工业界经常使用的数据库。该数据库是用物种名索引的。使用之前必须首先搞清楚你所研究物种的拉丁名(例如 homo sapiens)。
也可按字母浏览。不过在检索方式上,该数据库不象其他的生物信息学数据库那么灵活,其对检索词要求比较严格。可能的原因是有些物种的拉丁名非常相似(例如只差一个数字),如果出差错的话,就是“差之毫厘 谬以千里”。
因此,反复核对物种名应该是使用该数据库最重要的步骤。
如果要计算单个或一组基因可以用其提供的countcodon的服务(http://****kazusa.or.jp/codon/countcodon.html)。
密码子的偏好性怎么理解?
5楼:匿名用户
编码同一氨基酸的不同密码子称为同义密码,其差别仅在密码子的第3位碱基不同。
不同种属间使用同义密码的频率有很大差异,如人类基因中,丙氨酸(ale)密码子多为gca,gcc或gct,而gcg很少使用。
密码子偏爱性是什么?
6楼:匿名用户
不同的生物,甚至同种生物不同的蛋白质编码基因,对简并密码子使用频率并不相同,具有一定的偏爱性,其决定因素是:生物基因组中的碱基含量 在富含at的生物(如单链dna噬菌体fx174)基因组中,密码子第三位上的u和a出现的频率较高;而在gc 丰富的生物(如链霉菌)基因组中,第三位上含有g或c的简并密码子占90%以上的绝对优势。已知dnag和rpod(编码rna聚合酶亚基)及rpsu(30s核糖体上的s21б蛋白)属于大肠杆菌基因组上的同一个操纵子,而这3个基因产物在数量上却大不相同,每个细胞内仅有dnag产物50拷贝,而rpod为2800拷贝,rpsu则高达40 000拷贝之多。
研究dnag序列发现其中含有不少稀有密码子,也就是说这些密码子在其他基因中利用频率很低,而在dnag中却很高。许多调控蛋白如laci、arac、trpr等在细胞内含量也很低,编码这些蛋白的基因中密码子的使用频率和dnag相似,而明显不同于非调节蛋白。高频率使用这些密码子的基因翻译过程极容易受阻,影响了蛋白质合成的总量。
细胞内对应于稀有密码子的trna较少,高频率使用这些密码子的基因翻译过程容易受阻,影响了蛋白质合成的总量。
密码子与反密码子的定义
7楼:春素小皙化妆品
密码子(codon)指信使rna分子中每相邻的三个核苷酸编成一组,在蛋白质合成时,代表某一种氨基酸的规律。密码子(codon)指信使rna分子中每相邻的三个核苷酸编成一组,在蛋白质合成时,代表某一种氨基酸的规律。
遗传密码子为三联体密码:一个密码子由信使核糖核酸(mrna)上相邻的三个碱基组成。密码子具有通用性:不同的生物密码子基本相同,即共用一套密码子。
反密码子(anticodon):rna链经过折叠,看上去像三叶草的叶形,其一端是携带氨基酸的部位,另一端有3个碱基。每个trna(transfer rna)的这3个碱基可以与mrna上的密码子互补配对,因而叫反密码子。
扩展资料
遗传密码子无逗号:两个密码子间没有标点符号,密码子与密码子之间没有任何不编码的核苷酸,读码必须按照一定的读码框架,从正确的起点开始,一个不漏地一直读到终止信号。
遗传密码子不重叠,在多核苷酸链上任何两个相邻的密码子不共用任何核苷酸。
密码子具有简并性:除了甲硫氨酸和色氨酸外,每一个氨基酸都至少有两个密码子。这样可以在一定程度内,使氨基酸序列不会因为某一个碱基被意外替换而导致氨基酸错误。
密码子阅读与翻译具有一定的方向性:从5'端到3'端。
8楼:匿名用户
密码子定义:指信使rna分子中每相邻的三个核苷酸编成一组,在蛋白质合成时,代表某一种氨基酸的规律。
反密码子定义:rna链经过折叠,看上去像三叶草的叶形,其一端是携带氨基酸的部位,另一端有3个碱基。每个trna(transfer rna)的这3个碱基可以与mrna上的密码子互补配对。
构成rna的碱基有四种,每三个碱基的开始两个决定一个氨基酸。从理论上分析碱基的组合有4的3次方=64种,64种碱基的组合即64种密码子。
分析20种氨基酸的密码子表,同一种氨基酸可以由几个不同的密码子来决定,起始密码子为aug(甲硫氨酸) , 另外还有uaa、uag、uga三个密码子不能决定任何氨基酸,是蛋白质合成的终止密码子。
9楼:匿名用户
密码子codonm,rna分子中每相邻的三个核苷酸编成一组,在蛋白质合成时,代表某一种氨基酸。
反密码子(anticodon):rna链经过折叠,看上去像三叶草的叶形,其一端是携带氨基酸的部位,另一端有3个碱基。每个trna(transfer rna)的这3个碱基可以与mrna上的密码子互补配对,因而叫反密码子。
10楼:abc高分高能
遗传信息、密码子和反密码子的定义
11楼:
真核细胞rna合成分布 核仁 rrna
核质 hnrna
核质 trna 5srna
密码子的特性,密码子的特点有哪些? 5
1楼 匿名用户 遗传密码子是三联体密码 1个密码子由三个核苷酸组成。 密码子具有通用性 不同的生物密码子基本相同,即共用一套密码子。 遗传密码子无逗号 两个密码子间没有标点符号,,密码子与密码子之间没有任何不编码的核苷酸,读码必须按照一定的读码框架,从正确的起点开始,一个不漏地一直读到终止信号。 遗...
密码子的简并性是什么,生物:什么是密码子的简并性?详细!
1楼 匿名用户 同一种氨基酸具有两个或更多个密码子的现象称为密码子的简并性。 也就是多个密码子可以编码同一个氨基酸 编码同一种氨基酸的不同密码子可以称为同义密码子。 2楼 四十一 一种氨基酸有一个或多个密码子与之对应。 3楼 匿名用户 呵呵哈哈哈哈哈哈红红火火恍恍惚惚哈哈哈哈哈哈哈红红火火恍恍惚惚哈...
哪个大学锂离子电池研究最好,国内锂离子电池哪些大学研究比较好
1楼 欲淡却浓 山海交大,浙大,中南大学,厦门大学 都还是不错的 国内锂离子电池哪些大学研究比较好 2楼 匿名用户 国内研究锂离子电池比较好的大学,清华大学 上海交通大学 中国科学技术大学 北京理工大学 华东理工大学 华中科技大学 哈尔滨工业大学 浙江大学 东南大学 华南理工大学 北京化工大学 大连...