高通量测序中P1接头的作用及连接接头反应原理

2020-11-22 09:06:34 字数 2119 阅读 2807

1楼:土豆柠檬丝

接头在illumina中一般分为p5和p7接头,其中一个带有和flow cell上的探针反向互补的序列,以完成待测序列和探针结合的作用,另外一个接头带有barcord序列以区分不同的样本。

连接接头反应,其原理为序列打断后加碱基a,随后接头t单碱基互补连接。

测序中p1接头有什么用?用在哪?

2楼:土豆柠檬丝

要了解p1接头有什么用,首先要知道p1接头是什么?

p1接头是二代测序中加入到接头序列,主要包括和flow cell上互补的olgo序列和测序引物(一般barcord序列在p2接头上)

用处:1,与flow cell上的序列互补结合从而使待测序列结合到flow cell上 2.具有测序引物序列,使得测序能与待测文库片段结合,进而完成测序。

用在哪?p1接头一般是在文库构建中接到待测的片段上。另外在二代测序数据分析中,由于一些片段太短(比如你测序是测100bp,但是你的待测片段没有100bp长度),使得测序结果中有接头序列,我们在数据分析第一步中需要去除接头序列。

不过很少见,一般情况下,测到的都是p2接头,除非你的文库构建的长度范围比较广,才有可能在read2的测序中测到p1接头。

高通量测序中建库接头的作用反应及原理

3楼:**ile我的爱人

接头主要是为了测序,接头上含有测序引物互补结合的片段序列,通过和测序引物结合来对目的片段进行测序

高通量测序分的原理是什么?

4楼:天涯海角七楼号

对dna分子进行

序列测定。

1.对几十万到几百万条dna分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。

2.根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要有以下几种:大规模平行签名测序(massively parallel signature sequencing, mpss)、聚合酶克隆(polony sequencing)、454焦磷酸测序(454 pyrosequencing)、illumina (solexa) sequencing、abi solid sequencing、离子半导体测序(ion semiconductor sequencing)、dna 纳米球测序 (dna nanoball sequencing)等。

3.高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条dna分子进行序列测定,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测序(deep sequencing)。

参考资料

illumina高通量 标书怎么写

5楼:品印标书制作

太专业化了 不懂 还是专业标书公司看看吧

高通量测序建库接头和barcode是一回事吗

6楼:**ile我的爱人

不是的,接头是先加上去的,barcode是后加上去的,barcode 的作用是为了区分不同的样本的数据

高通量测序中index什么作用

7楼:**ile我的爱人

起区分各样本数据的作用,每个样本都有不同的index,在测序的时候会通过index 的不同将样本的数据分开,形成不同的文件夹

基因组高通量测序的原理

8楼:暴走少女

测序方案建立在双脱氧测序法(sanger等,1977)的基础上。为了从每一克隆插入片段两端成对地进行测序,每一个质粒模板dna板应配备两个384孔循环测序反应板。

机械臂负责等分模板试样,起与反应液混合的作用,反应液含有双脱氧核苷酸、荧光标记的核苷酸、taqdna聚合酶、序列引物和缓冲液。

模板和反应板有条形码,且在biomekfx移液操作工作站上有条形码读取器跟踪,确保模板和反应液转移中没有错误。30~40线性扩增步骤连续循环在mjresearchtetrads或9700热循环仪(ap—pliedbiosystems)中进行。