实时荧光定量pcr内参是什么东西

2021-03-05 09:15:15 字数 3147 阅读 2601

1楼:禾鸟

1、实时荧光定量pcr内参:

在不同的pcr反应管中已定量的内参和引物,内参用基因工程方法合成。上游引物用荧光标记,下游引物不标记。在模板扩增的同时,内参也被扩增。

在pcr产物中,由于内参与靶模板的长度不同,二者的扩增产物可用电泳或高效液相分离开来,分别测定其荧光强度,以内参为对照定量待检测模板。

2、选择:内参一般是固定的,可以用实验室之前就有的。或者用基因工程方法合成。上游引物用荧光标记,下游引物不标记。

扩展资料

(1)内参在传统定量中的作用:

由于传统定量方法都是终点检测,即pcr到达平台期后进行检测,而pcr经过对数期扩增到达平台期时,检测重现性极差。同一个模板在96孔pcr仪上做96次重复实验,所得结果有很大差异,因此无法直接从终点产物量推算出起始模板量。

加入内参后,可部分消除终产物定量所造成的不准确性。但即使如此,传统的定量方法也都只能算作半定量、粗略定量的方法。

(2)内参对定量pcr的影响:

若在待测样品中加入已知起始拷贝数的内标,则pcr反应变为双重pcr,双重pcr反应中存在两种模板之间的干扰和竞争,尤其当两种模板的起始拷贝数相差比较大时,这种竞争会表现得更为显著。

但由于待测样品的起始拷贝数是未知的,所以无法加入合适数量的已知模板作为内参。也正是这个原因,传统定量方法虽然加入内参,但仍然只是一种半定量的方法。

2楼:小笑聊情感

实时荧光定量pcr内参是一种在dna扩增反应中,以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(pcr)循环后产物总量的方法。通过内参或者外参法对待测样品中的特定dna序列进行定量分析的方法。

3楼:匿名用户

内参就是一个表达量在各个组基本保持不变的基因,又叫看家基因,比如常用的gapdh, actin。或者18s rrna也可以。

如果内参表达量一致,说明你pcr的上样量一致,样本的质量也一致。如果出入很大,说明你的样本的浓度或者是质量有问题。测到的目的基因的表达量就不可靠了

4楼:匿名用户

管家基因,具体可以咨询公司,也可以自己看文献,常用的有gapdh,beta-actin和18srna,根据不同的**选用不同的管家基因,比如gapdh就被人诟病做癌细胞基因时超不准。。。

5楼:xueling黄

如果对内参要求很高的话,可以筛选合适内参,有免费的软件,比如genorm,normfinder等

什么是实时荧光定量pcr?有什么作用?请详细说明。

6楼:月光_倾城

好多生物工作做广告做培训噢。你怎么不去看一下。

什么是实时荧光定量pcr,检测指标是什么?

7楼:奔马的香香猪

实时检测pcr扩增,在扩增的指数期对起始模板进行定量,在扩增过程中,荧光信号随着pcr产物的增加而增强。我们实验室使用的bioghsc super probe kit pcr实验检测dna,测得的循环数在28左右,整个pcr过程有4个阶段,基线期---指数增长期---线性增长期---平台期,指数增长期内,pcr有高度重复性,一般的检测指标是看线性图谱的扩增曲线的起跳值(ct值)。

8楼:钱塘书生

你要检测什么东西啊?

实时荧光定量pcr是检测模板dna的拷贝数、基因表达量、基因突变等的

9楼:阅微基因

所谓实时荧光定量pcr技术,是指在pcr反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个pcr进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。参考资料:http:

//baike.baidu.***/view/1020950.htm

实时荧光定量pcr的结果该怎样分析?

10楼:群英斗将

1、如果有标准曲线,按照标准曲线计算;

2、一般都是相对量,则用delta delta ct方法来计算;

3、引物或探针降解:可通过page电泳检测其完整性;

4、模板量不足:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;

5、看ct值是分析荧光定量pcr最直观的一个数据,ct值一般在35左右就失去参考价值了,平时我们实验室用biodai-pcr荧光定量法测得的扩增曲线的起跳值基本在30左右。

扩展资料:

pvr的循环参数:

1、预变性;

模板dna完全变性与pcr酶的完全激活对pcr能否成功至关重要,加热时间参考试剂说明书。

2、变性步骤;

循环中一般95℃,30秒足以使各种靶dna序列完全变性,可能的情况下可缩短该步骤时间。变性时间过长损害酶活性,过短靶序列变性不彻底,易造成扩增失败。

3、引物退火;

退火温度需要从多方面去决定,一般根据引物的tm值为参考,根据扩增的长度适当下调作为退火温度。然后在此次实验基础上做出预估。退火温度对pcr的特异性有较大影响。

4、引物延伸;

引物延伸一般在72℃进行(taq酶最适温度)。但在扩增长度较短且退火温度较高时,本步骤可省略延伸时间随扩增片段长短而定,一般推荐在1000bp以上,含pfu及其衍生物的衍生设定为1min/kbp。

5、循环数;

大多数pcr含25-35循环,过多易产生非特异扩增。

6、最后延伸;

在最后一个循环后,反应在72℃维持10-30分钟.使引物延伸完全,并使单链产物退火成双链。

11楼:南京金益柏生物科技****

用2-△△ ct法算的话,应如何算? 假设检测a基因,ct分别为(这里记住ct越大,表明相对含量越低) 普通组/test1:28 实验组1/test2:

29 实验组2/test3:30 这时候要设对照了,假设test1为对照组(普通组),当然是以普通组为对照 那么,相对含量为。

12楼:匿名用户

看ct值、起始拷贝数、标准偏差等

如果是sybr做的话,再看下溶解曲线

实时荧光定量pcr之前要不要做个内参基因的筛选

13楼:匿名用户

通常不需要,因为我们已经很清楚每个内参的属性。但还需要看你用定量做什么,比如说做组织表达,或者诱导表达,我们都会偏好于不同的内参。

实时荧光定量pcr和定量pcr有什么区别

1楼 匿名用户 实时荧光是反应荧光数值定量,普通那种是通过条带半定量,现在做半定量的已经很少了,除非是一些验证试验必须要图的 实时荧光定量pcr与普通pcr的区别是什么?结果有何异同?能说明的问题是什么? 2楼 么破1自我 二者结果相同。都能说明生物体外的特殊dna复制的整个过程的扩增效率和溶解温度...

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