1楼：匿名用户
表面意思是指一个序列标签，实际上是指一条read，就是测序仪读取的一条序列。
请问高通量测序中的序列标签是什么意思？
2楼：护发之家
教程的初稿已经整理好，相关也在附件中，请多多指教。希望能对虫友们有帮助。如果有问题，随时反馈，更新！
数据库改版了，现在提交数据的步骤和这个教程有些出入，但是整体思路还是一样的！
总有人说有木马，我当时上传的时候没有木马！我特意自己下来看了下，好像真的有。介意的就不要了。建议大家把数据传到欧洲那个数据库，操作很简单。
高通量测序中的 read contig scaffold和tag分别代表什么？ 30
3楼：士诚小人也
read是读长，就是
一个反应能测出的碱基数
congtig是将很多read根据序列拼接在一起拼出的片段，理论上同一个染色体上的read结合起来拼出一个contig，但实际上做不到。contig中所以的碱基序列是已知的
在高通量测序前，会构建一定长度的文库（譬如8k的文库），测序时是将文库中的每一个dna从两头测序，获得两端序列信息，此外还会知道你从每一条dna上所测两条序列是在同一个片段上的。根据这个信息，可以将contig连接起来，这就是scaffold。在scaffold中会有部分序列信息未知
4楼：廖方耀
在高通量测序前，会构建一定长度的文库（譬如8k的文库），测序时是将文库中的每一个dna从两头测序，获得两端序列信息，此外还会知道你从每一条dna上所测两条序列是在同一个片段上的。根据这个信息，可以将contig连接起来，这就是scaffold。在scaffold中会有部分序列信息未知。
5楼：匿名用户
scaffold就是多个contig的连接物，但其部分序列未知而已，说白了都是一段序列！tag 也是一段序列，比较短的，可以作为标注其他序列的序列，相当于路标！
6楼：占芷波藤蝶
给你举个例子，比如一个基因组大小是1m，测序得到若干条reads，这些reads进行拼接，如果完全可以拼接起来，中间没有gap的序列称为contig，即连续的意思。
如果中间有gap,但是可以知道gap的
长度，这样的序列就叫做scaffold,
即脚手架（非连续）的意思。
然后把contig
和scaffold
从长到短进行排列，然后相加，当恰好加到1m的50％，也就是500k的时候
，那一条contig
或者scaffold
的长度就叫做contig
n50和scaffold
n50。很明显这个数值越大说明组装的质量越好。
高通量测序平台怎么产生序列标签
7楼：匿名用户
序列标签？是index吗，你指的产生是测序时候？还是生产，这都是商业化的东西的，都处理好的。
sequencing adaptor,multiplex identification dna-tags是什么意思
8楼：匿名用户
测序接头：测序一段序列需要给dna两端加上一段dna接头
multiplex identification dna-tags：就是index，许多的序列在一起测序，通过给不同的序列加上不同的标签来区分
测序的分辨率（resolution）是什么意思？在高通量测序里经常出现的词汇
9楼：匿名用户
resolution 在测序的时候是指对碱基信号的分辨能力，尤其是在达到测序极限后（一般的机器为几百碱基对，就会出现信号模糊，无法再分辨了，这就是分辨率不行了
高通量测序中index什么作用
10楼：**ile我的爱人
起区分各样本数据的作用，每个样本都有不同的index，在测序的时候会通过index 的不同将样本的数据分开，形成不同的文件夹
高通量测序技术 中的“高通量” 是什么意思
11楼：夏维迩
高通量是相对于第一代测序的，第一代测序只能一次测1个样品的1段序列，产生的数据量相对来说很小，而高通量测序一次能够产生的数据量在几十g上百g，可以一次测很多的样本。
在2000年的时候，3700、megabace等仪器上的测序也是高通量测序，是相对手工测序或者跑平板胶来说的。
不过到2005年以后，高通量测序就改指第二代测序（next generation sequencing），454、solexa(后改为illumina）和solid等第二代测序，比3730等第一代测序的通量提高了成千上万倍，甚至上亿倍，所以称为高通量测序。
扩展资料
高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变，一次对几十万到几百万条dna分子进行序列测定，同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能，所以又被称为深度测序(deep sequencing)。
利用毛细管测序仪的转变解决了凝胶板技术内在的通路追踪问题，毛细管测序仪的自动化显著提高了处理量，同时提供了更长的可测序长度。这些进展显著增加了近些年产生的人类病原体的基因组数据。
当前主要的测序技术平台，主要分为：
1、solexa测序技术（即大家耳熟能详的illumina测序）；
2、454测序技术（即焦磷酸测序技术）；
3、solid测序技术（双色编码技术）。
总体而言，高通量测序技术的诞生可以说是基因组学研究领域一个具有里程碑意义的事件。该技术使得核酸测序的单碱基成本与第一代测序技术相比急剧下降。
12楼：**ile我的爱人
打个比方，一代测序一次测序只能够对1个基因进行测序，而高通量测序能够一次检测几十甚至几百个基因，这就是高通量，同时产生的数据也很巨大，一代测序一次测几百bp，高通量测序一次测几个gbp
高通量测序中的otu observed是什么意思
13楼：又见永久和久远
observed
英-[b'zvd]
美-[b'zvd]
释义v. 观察；遵守；注意到；庆祝（observe的过去分词形式）adj. 观察的；观测的
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