1楼:武汉徐东律师
oracle 和 sql server: 单行 --这后边就是注释 多行 /* 这里是注释 这里是第二行注释 */
转录组差异基因表达的nr注释是什么意思
2楼:马瓦里奥
nr是一个数据库,是ncbi中蛋白质数据库,集合了许多其他数据库中的蛋白质的注释信息。差异基因注释简单来说就是把有表达差异的unigene的物种、分子功能、生物学途径等等信息通过从数据库中比对,得到的结果。
转录测序中的nr,nt,swissprot,cog,kegg,go分别是什么意思
3楼:匿名用户
nr库属于非冗余蛋白序列数据库,是ncbi官方的蛋白序列数据库,数据**于genpept、swissprot、pir、pdf、pdb以及ncbi refseq,是默认的蛋白比对数据库。
nt数据库是美国国家生物技术信息中心ncbi官方的核酸序列数据库,nt库属于非冗余核酸序列数据库,数据**于genbank、embl 以及 ddbj,是ncbi默认的核酸blast比对数据库。
swissprot数据库是检查过的、手工注释的蛋白数据库,我们将unigene注释到swissprot数据库,以得到更加高质量的注释结果。
cog (clusters of orthologous groups)主要是原核生物和单细胞真核生物的直系同源物,kog(clusters of eukaryotic orthologous groups)数据库包含了7个完整基因组的真核生物的直系同源家族蛋白, 构成每个 kog 的蛋白集是被假定为来自于一个祖先蛋白,根据系统发生进行分类,一般cog指原核生物,kog指真核生物,kog与cog提供了相似的基因同源物的分类信息。
kegg (kyoto encyclopedia of genes and genomes) 是处理基因组、生物通路、疾病、药物和化学物质之间联系的集成数据库。 kegg用于生物信息研究等,包括基因组,代谢组学等其他组学的数据分析,涵盖了drug development(药物开发)、 cellular processes(细胞过程)、 environmental information processing(环境信息处理)、ge***ic information processing(遗传信息处理)、 human diseases(人类疾病), metaboli**(代谢)、 ***ani**al systems(有机系统)等方面。
go( gene ontology ): 基因本体。生物技术的发展迅速,数据越来越多,不同数据库命名标准不统一,为了解决不同的生物学数据库可能会使用不同的术语的问题,从而基因本体联合会(gene onotology consortium)开发go来描述基因在分子、细胞和组织水平的功能体现。
go的基本描述单元是go terms。go主要包括三个分支: 生物过程(biological processes)、分子功能(molecular function)和细胞组成(cellular ***ponents),用于描述基因产物的功能。
go中使用了is_a、part_of和regulates三种互作关系。
4楼:天马行空设计
基因组注释分析主要包括哪些内容
基因组注释包括以下方面的内容:
(1) 重复序列的**。通过比对已知的重复序列数据库,找出序列中包含的重复序列,识别类型并转化为n或者x,统计各种类型重复序列的分布。
(2) 编码基因的**。通过将转录组或est数据比对到拼接后的基因组序列上,找出编码基因位置,**编码基因结构。或者通过专业的外显子**软件,**编码基因的外显子结构。
(3) 小rna基因的**。通过比对已知的小rna的数据库,或者通过生物信息(bioinformation)学软件**,找出这些小rna基因,并进行分类。
(4) 调控序列和假基因的**。
基因功能的注释,使用的数据库包括nt/nr, swissprot/trembl, interpro, kegg, cog, gene ontology等,使用比对的方法,如blast,找出同源相近的基因,并注释功能。
请问湘西共有多少个少数民族?其中以哪几个为主呢
1楼 匿名用户 湘西全称湘西土家族苗族自治州 地处湖南省西北部 与湖北 贵州 重庆三省市接壤 辖吉首市及泸溪 凤凰 古丈 花垣 保靖 永顺 龙山七县 过去 湘西还包括桑植和大庸两县 88年后它们划归大庸市 即今日的张家界 地级 市 湘西总人口260余万 其中 少数民族约194万 少数民族主 要包括土...