CpG岛的概述,CpG岛的意义

2020-11-21 18:59:29 字数 3415 阅读 2006

1楼:迷迭逆夏咑

cpg岛(cpg island):cpg双核苷酸在人类基因组中的分布很不均一,而在基因组的某些区段,cpg保持或高于正常概率。cpg岛主要位于基因的启动子(promotor)和第一外显子区域,约有60%以上基因的启动子含有cpg岛。

cpg岛的gc含量大于50%,长度超过200bp。

cpg岛的意义

2楼:因为爱

许多基因,尤其是管家基因的启动子区,其中通常存在一些富含双核苷酸“cg”的区域,称为“cpg岛”(cpg island)。研究碱基g和c在整个基因组内的含量和分布有十分重要的意义。例如在人类基因组内,gc的含量大约为40%;这些gc并不是平均分布在基因组内,在某些dn**段上其含量可高达60%以上,而在另一些区域则只有33%左右。

这种gc含量的差别,在基因表达的调控和基因突变上都可能扮演着重要的角色。在人类基因组内,存在有近3万个cpg岛;在大多数染色体上,平均每100万碱基含有5~15个cpg岛,其中有1.8万多个cpg岛片段的gc含量为60%~70%。

通常,这些cpg岛不仅是基因的一种标志,而且还参与基因表达的调控和影响染色质的结构。例如, 除定位于失活x染色体上的基因、印迹基因和非表达的组织特异基因(奢侈基因)外,正常细胞的cpg岛由于被保护而处于非甲基化状态。

全基因组低甲基化,维持甲基化模式酶的调节失控和正常非甲基化cpg岛的高甲基化是人类肿瘤中普遍存在的现象.。以往的研究证明启动子区的高甲基化导致抑癌基因失活是人类肿瘤所具有的共同特征之一,而且这种高甲基化是导致抑癌基因失活的又一个机制。

另外,原核生物细菌dna含有高频率的cpg双核苷,约为1/16,细菌dna和某些含非甲基化cpg双核苷的多聚核甘酸能够刺激鼠和人淋巴细胞。高等脊椎动物出现cpg双核苷频率为1/50,且多为甲基化,真核细胞和甲基化的多聚核甘酸则不能刺激鼠和人淋巴细胞。cpg结构与细菌dna同源性要高于脊椎动物细胞。

cpg dna可直接刺激b细胞、巨噬细胞和dcs细胞分泌细胞因子。特别是th1样细胞因子如il-12和 il-18;细胞表达协同刺激因子分子,显示增强抗原递呈作用。cpg dna可诱导强烈的th1样应答提示这些分子可作为疫苗的佐剂,抵抗各种目标,包括感染性物质,肿瘤抗原,过敏原等。

cpg岛是什么东东

3楼:巨蟹清晨的风

由胞嘧啶(c)和鸟嘧啶(g)组成的一个2个核苷酸的链,当中的p是c和g之间的磷酸

cpg岛就是由胞嘧啶(c)和鸟嘧啶(g)组成的串联重复序列

cpg岛相关

4楼:匿名用户

cpg岛具有重要的招募转录因子的作用,其高甲基化状态会影响其对转录因子的招募,从而降低下游基因的转录活性,即影响了基因表达。cpg岛是一段富含cg的序列,其甲基化程度可以不同。

cpg岛甲基化表型是什么意思? 5

5楼:匿名用户

在正常组织里,70%~90%散在的cpg是被甲基修饰的,而cpg岛则是非甲基化的。正常情况下,人类基因组“垃圾”序列的cpg二核苷酸相对稀少。

并且总是处于甲基化状态,与之相反,人类基因组中大小为100-1000bp左右,富含cpg二核苷酸的cpg岛则总是处于未甲基化状态。当cpg岛出现甲基化表型,涉及到多个基因启动子同时甲基化,具有肿瘤特异性,与多种肿瘤的发生或预后相关。

6楼:匿名用户

【cpg岛甲基化表型】在

正常组织里,70%~90%散在的cpg是被甲基修饰的,而cpg岛则是非甲基化的。正常情况下,人类基因组“垃圾”序列的cpg二核苷酸相对稀少,并且总是处于甲基化状态,与之相反,人类基因组中大小为100-1000bp左右,富含cpg二核苷酸的cpg岛则总是处于未甲基化状态。当cpg岛出现甲基化表型,涉及到多个基因启动子同时甲基化,具有肿瘤特异性,与多种肿瘤的发生或预后相关。

【cpg岛(cpg island)】:cpg双核苷酸在人类基因组中的分布很不均一,而在基因组的某些区段,cpg保持或高于正常概率,这些区段被称作cpg岛,在哺乳动物基因组中的1~2kb的dn**段,它富含非甲基化的cpg双倍体。cpg岛主要位于基因的启动子(promotor)和第一外显子区域,约有60%以上基因的启动子含有cpg岛。

7楼:匿名用户

背景与目的:cpg岛甲基化表型(cpgislandmethylatorphenotype,cimp)涉及到多个基因启动子同时甲基化,具有肿瘤特异性,与多种肿瘤的发生或预后相关,但有关肝癌cpg岛甲基化表型的研究罕见报道。opcml(opioid-bindingprotein/celladhesionmolecule-like)基因目前多为针对上皮性卵巢癌的研究,被认为是卵巢癌的候选抑癌基因。

本研究旨在**cimp及opcml基因与肝癌的发生是否有关。方法:运用甲基化特异性pcr方法检测50例肝细胞癌组织及48例癌旁组织中opcml、p15、socs-1、gst-p、rar-b、p16、p73、p14、mgmt和hmlh1基因的甲基化状况。

结果:肝癌组织甲基化率普遍比相应癌旁组织甲基化率高:opcml(70.

0%vs.64.6%)、p15(58.

0%vs.50.0%)、socs-1(78.

0%vs.50.0%)、gst-p(56.

0%vs.27.1%)、rar-b(30.

0%vs.6.3%)、p16(26.

0%vs.14.6%)、p73(16.

0%vs.0%)、p14(36.0%vs.

27.1%)、mgmt(16.0%vs.

10.4%)和hmlh1(18.0%vs.

4.2%)。socs-1,gst-p,rar-b,p16和p73基因甲基化率在肝癌组与癌旁组差异有显著性(p0.

05),其它基因两组之间的甲基化率差异无显著性。cimp阳性组(同时具有≥3个位点甲基化)**时间较早,1年无瘤生存率为18.2%,而cimp阴性组(具有3个位点甲基化)**时间较晚,1年无瘤生存率为75.

0%(p0.05)。结论:

肝癌中存在着cpg岛甲基化表型(cimp),cimp可作为肝癌患者预后判断的指标之一;opcml基因甲基化可能在肝癌的发生中发挥重要的作用。

cpg岛为什么要有个"p",而不叫cg岛?p有什么特殊含意?

8楼:蔚蓝的爱恋

cpg是胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤的缩写,p代表磷酸

如何查找一个基因的cpg岛

9楼:

基因启动子位于基因转录起始位点的上游几kb的区域内,一般来说启动子区域具有一定的保守序列特征,另外,启动子区域一般还具有比较高比例的gc含量,这些高gc含量的区域组成一些gc岛;如果一个新的基因在不能确定其启动子的情况下,最好在设计pcr引物时,多设计几对,最大限度地将新基因的启动子区域囊括在这些pcr里面。。如:你可以分析一下,得到高gc含量的区域,然后在涵盖这个区域设计一系列的引物,然后pcr。

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